文章题目：A high-resolution transcriptomic and spatial atlas of cell types in the whole mouse brain

发表时间：2023年12期刊名称：Nature

影响因子：5839

实验平台：10x单细胞测序；MERFISH数据集

01 研究概述

本研究主要目标是绘制小鼠全脑细胞类型图谱。通过单细胞转录组分析（scRNA-seq）和单细胞核转录组分析（snRNA-seq），研究人员成功鉴定了小鼠大脑内不同的细胞类型，并结合MERFISH数据，根据细胞的空间位置及其类型将这些细胞划分为七个邻域，以便于后续深入分析。

02小鼠大脑神经元空间分类

在小鼠大脑细胞类型中，神经元细胞类型占据了重要地位，并显示出高度的区域特异性。研究针对神经元细胞群体进行了深入探讨，确认不同神经元细胞类型的区域特性。结果共鉴定出六个神经元亚群的邻域，包括大脑皮层形成的独特的皮层-谷氨酸邻域，以及来自不同脑区的GABA能神经元亚类等。

03 非神经元和未成熟神经元细胞类型分类

研究还分析了五个非神经元细胞类型、四个未成熟神经元类型及四个颗粒细胞类型的空间分布特征。在所有非神经元细胞类型中，Astro-Epen类展现出最为多样的空间分布模式，室管膜的不同亚类则显示了在大脑各个脑室的精细空间特异性。

04 大脑区域特定的细胞类型特征

为比较所有细胞类型转录组的相似性和空间分布的邻近性，研究使用脑组织的MERFISH数据集，量化了各细胞亚类的全脑空间分布模式。结果显示，所有神经元亚类大多集中于特定脑区，而非神经元亚类则在整个脑部广泛分布。此外，转录组相近的细胞类型在空间上相互靠近，提示不同区域的细胞类型数量与细胞密度并无直接相关性。

02 文章小结

本研究通过单细胞与空间技术的结合，绘制了小鼠整个大脑的空间细胞图谱，并系统性分析了神经元和非神经元细胞类型，探讨了它们的转录组和空间特异性之间的关系。结果揭示了不同大脑区域细胞类型组织的独特特征，尤其是大脑背侧与腹侧部分的显著差异。背侧部分包含较少但高度分化的神经元类型，而腹侧则拥有更多样的神经元类型。总体而言，全面的小鼠大脑空间细胞图谱为未来的脑部相关研究提供了有力的参考，也为尊龙凯时相关的生物医疗领域打下了理论基础。