导读：非规范翻译产物（例如新多肽）的系统鉴定和功能表征将有助于深化对人类基因组的理解，同时为细胞生物学提供新的洞察。本研究构建了一个包含11,668,944个开放阅读框的高覆盖率肽测序参考文库，并通过超滤串联质谱技术鉴定出新多肽。通过这些方法，从正常胃组织、胃癌组织和细胞系中发现了8945个先前未注释的肽，近一半来自非编码RNA。此外，CRISPR筛选显示1161个肽参与肿瘤细胞的增殖。基于筛选分数、氨基酸长度及其他指标，选择了这些肽的子集，并通过Flag-knockin及多种其他方法进行了验证，以确认其存在和生理功能。

为了进一步表征这些潜在调控机制，研究构建了一个基于人工智能的结构预测和肽-蛋白相互作用网络分析框架，揭示了这些癌症相关肽在细胞器特异性过程中具有不同的亚细胞位置。研究还确认了pep1-nc-OLMALINC、pep5-nc-TRHDE-AS1、pep2-nc-AC0270453和pep1-nc-znf436-as1的相互作用伙伴，以及它们在线粒体复合物组装、能量代谢和胆固醇代谢中的功能。结果表明，pep5-nc-TRHDE-AS1和pep2-nc-AC0270453在异种移植